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在Western Blot過程中，分子量Marker就像個螺絲釘一樣沒雖然是個小細節(jié)，然而就是這樣一個小細節(jié)對實驗結(jié)果有著不可忽視的作用。這個 Western Blot參照家族的一員的作用主要是用來指示蛋白條帶所對應(yīng)的分子量大小，只有標準量精確無誤了，實驗結(jié)果才有說服力，除此之外，蛋白標準還有表示轉(zhuǎn)移成功或者蛋白在凝膠上的電泳程度等等的作用，所以選擇正確的蛋白Marker也是western blot實驗成功的必要條件。

總體來說，蛋白分子量標準可以分成未染蛋白分子量標準、預(yù)染蛋白分子量標準二個級別。以下是關(guān)于蛋白分子量標準的小敘：

一. 未染色（pre mixed）蛋白分子量標準
未染色的蛋白分子量標準是*簡單，也是*準確的一種。由于沒有附帶染料分子或者是標記分子，所示大小正好是蛋白原本的大小，是精確判斷蛋白大小必須的�，F(xiàn)在的Marker多數(shù)都選用預(yù)混和的Marker，方便不同大小的蛋白比較。預(yù)混的Marker通常有幾條帶加倍濃度作為指示，因為混合的條帶越多，越不好記，誰知道哪條是那條！數(shù)到眼都花了。所以當看到特別濃的那幾條標志帶就記得是哪里了。不過要記得，小帶通常都不那么容易看清楚的。在選擇上來說，當然是選擇其中至少有一條條帶和自己的目的蛋白大小相近的，越近越好。如果你的蛋白不幸在兩條跨度較大Marker條帶之間，選別的Marker吧。預(yù)混的Marker使用上不如預(yù)染Marker（pre-stained）好用，因為電泳過程中完全看不到，要和目標蛋白一起等到*后染色才“開蠱”，無法對實驗起預(yù)示參照作用。完全屬于“后知后覺”型的，當然還是比“不知不覺”不做對照的要好。

① 寬分子量蛋白標準
如果從實驗室總體考慮的，就選范圍盡量寬，條帶分布比較均勻的，這樣你的蛋白無論在哪個區(qū)間都容易判斷，避免正好落在一段空白區(qū)的危險。不過條帶越多，每次上樣量也就越費。拿到Marker后，如果買的是大包裝，就應(yīng)該考慮分裝。多次反復(fù)凍融對于蛋白的危險，不用多說吧。另外要記得，寬譜的Marker不一定每條都能看到的，特別是Mini Cell。如果側(cè)重大蛋白，那小的可能就已經(jīng)跑掉了，不是質(zhì)量不好哦。

② 高分子量蛋白標準
通常在檢測大分子量蛋白經(jīng)常使用到高分子量蛋白標準，

③ 低分子量蛋白標準
在一般的蛋白電泳當中，更常用的是低蛋白標準分子量，除了有指示蛋白大小的作用以外，有時還可以用作粗略的定量。實驗室用在一般蛋白電泳的低分子量蛋白標準中。

在低分子量蛋白標準這里還包括可特別小的蛋白標準，比如30kD以下蛋白或者多肽的分離辨別。其中GE的從2kD到16kD之間有6條帶的蛋白標準挺不錯，另外提醒一句，特別小的蛋白Marker條帶如果要顯色好，上樣一定要上足夠的量哦。

二.預(yù)染蛋白分子量標準
預(yù)染蛋白分子量是一些純化好的蛋白混合物，通過與染料共價耦聯(lián)，在電泳過程中或者轉(zhuǎn)膜時可以直接觀察到。預(yù)染蛋白分子量的出現(xiàn)方便了我們的實驗，這種蛋白分子量標準可以幫助我們在電泳時、電泳后，以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率——比如，已知垂直電泳*佳分辨區(qū)域大約在膠的2/3處，如果使用預(yù)染Marker就可以預(yù)測目標蛋白進入*佳分辨區(qū)時停止電泳以得到*佳分辨效果；如果觀察到Marker電泳異常也可以及時終止電泳；另外在Western Blot轉(zhuǎn)膜以后可以直接觀察蛋白轉(zhuǎn)膜是否完全，還可以在膜上標記蛋白分子量，所以吸引了許多實驗室人員購買預(yù)染蛋白標準。值得注意的是預(yù)染蛋白Marker與染料共價耦聯(lián)，所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發(fā)生某些變化，可能導(dǎo)致一些偏差，所以不太適合精確定位蛋白——不過多數(shù)情況下Marker的條帶未必能和我們的目標蛋白完全一樣，我們得到的也不過是一種相對Marker指示的參考大小，*后都需要Western來定性，所以如果不是要區(qū)分大小相近的條帶，預(yù)染Marker還是很好用的，而且也可以和未染色的蛋白標準一起使用。

預(yù)染蛋白標準可以分為兩種：單色預(yù)染和多色預(yù)染，其實區(qū)別就在于幫助在實驗過程中辨認某個條帶的大小——Marker條帶越多參考價值越大，可就越難辨認區(qū)分，如果用不同的顏色來區(qū)別就比較好辨認啦。如果沉悶的電泳實驗中跑出五顏六色的彩虹Marker，此時心情想必會愉快一些！單色的Marker通常是利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小的。還有一點特別要注意，由于轉(zhuǎn)膜是一個將膠里的Marker濃縮在潔白的膜上，所以需要的上樣量相對少一些，如果想要在電泳過程中看到美麗的“彩虹”，或者單色的Marker往往需要比說明書里多加一些Marker的。

原創(chuàng)作者：上海遠慕生物科技有限公司