相信大家作為實(shí)驗(yàn)小白,剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室時(shí),學(xué)的個(gè)實(shí)驗(yàn)就是提
質(zhì)粒。
想當(dāng)年我們作為化學(xué)轉(zhuǎn)生物的研究生剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室時(shí),覺得好酷炫的技術(shù),跟在師兄后面,認(rèn)真的對(duì)每一步的步驟都做好筆記,后來才發(fā)現(xiàn)你自己不過是做了一份手寫版的說明書。
接下來的 N 年里,就是轉(zhuǎn)化,涂板,挑單克隆,搖菌,提質(zhì)粒,酶切,連接,好想能夠有一個(gè)提質(zhì)粒機(jī)器人,實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化生產(chǎn)。當(dāng)我們習(xí)慣了省時(shí)省力,或許我們都已經(jīng)連提取的原理都已經(jīng)忘了。
那么如何避免成為一個(gè)機(jī)器人呢,我想不僅僅是要提的出質(zhì)粒,還要在出現(xiàn)問題時(shí)知道如何找到原因并解決,這樣你就可以被稱為人工智能,簡稱 AI。
質(zhì)粒是攜帶外源基因進(jìn)入細(xì)菌中擴(kuò)增或者表達(dá)的重要媒介,常用的方法有煮沸裂解法,堿提法等。而我們常用的 kit 是采用堿提法。
不同品牌的
試劑盒具體操作步驟可能不同,但這個(gè)萬變不離其宗,基礎(chǔ)知識(shí)點(diǎn)還是不變的。
菌體在強(qiáng)堿性條件下裂解,釋放出包括質(zhì)粒在內(nèi)的核酸,
蛋白等物質(zhì)。
當(dāng) pH 恢復(fù)中性時(shí),共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒 DNA 復(fù)性快,而線性的染色體 DNA 復(fù)性緩慢,細(xì)菌蛋白質(zhì)、破裂的
細(xì)胞壁和變性的染色體 DNA 會(huì)相互纏繞成大型復(fù)合物,而后者被十二烷基硫酸鹽包蓋。
當(dāng)用鉀離子取代鈉離子時(shí),復(fù)合物會(huì)從
溶液中有效地沉淀下來,離心除去變性劑后,就可以從上清中回收復(fù)性的質(zhì)粒 DNA。
未提出質(zhì);蛘叩寐瘦^低?
1、菌。用錯(cuò)板子導(dǎo)致菌沒有長起(抗生素的種類和濃度)
搖過夜一不小心第二天忘記了此時(shí)多半菌液老化
2、堿裂解不充分。高速離心收菌倒掉上清后,能彈彈彈(彈不走魚尾紋)
3、溶液使用不當(dāng)?辞迥男┤芤簯(yīng)加熱到一定的溫度才能使用;哪些又是應(yīng)該 加入醇之后使用
4、拷貝數(shù)較低或者菌體中無質(zhì)粒。低拷貝數(shù)載體常常導(dǎo)致質(zhì)粒 DNA 提取量過低;質(zhì)粒在某些菌體中經(jīng)過多次轉(zhuǎn)接可能出現(xiàn)丟失;
基因組 DNA 或蛋白質(zhì)污染!
1、加溶液 2 后不要?jiǎng)×覔u晃,溶液 2 處理時(shí)間不能太久,一般顛倒 6-8 次即加溶液 3 中和,堿裂解時(shí)間過長容易產(chǎn)生基因組污染;
2、加溶液 3 后要混合充分,離心后取上清小心不要吸到白色沉淀;
3、不要使用過多菌體。溶液 P1、P2、P3 處理并離心后溶液應(yīng)為澄清的,如果還混有微小蛋白懸浮物,可再次離心。
不過我們也不能死搬硬套,也要學(xué)會(huì)融會(huì)貫通,舉一反三,當(dāng)出現(xiàn)超出大綱范圍的題目如出現(xiàn) 15kb 的大型質(zhì)粒,這時(shí)要注意采用溫和的方法(溶菌酶法),因?yàn)閯×业姆椒ㄈ菀资顾艿狡茐摹?br />
俗話說的好,每日一提,強(qiáng)身健體。不過小提怡情,大提還需謹(jǐn)慎啊,當(dāng)聽說曾經(jīng)發(fā)生過由于沒有配平而出現(xiàn)
離心機(jī)直接旋出甚至將天花板損壞的壯觀場景,你們能想象我如今坐在高速離心機(jī)旁邊的心情嗎,(幸好我買了保險(xiǎn))。
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