Western Blot是生物修煉的一大實驗，現(xiàn)在不做定量Western Blot，都不敢自詡學(xué)霸的了，暗暗擦汗的有沒有？在討論如何從Western Blot中獲得定量數(shù)據(jù)之，先定義一下我們所說的“定量”是什么意思是非常有用的，何為定量，必須符合下列準(zhǔn)則：
使用一個定義的過程進行檢測，即Western Blot。
這個過程產(chǎn)生一個可重復(fù)的結(jié)果，即是精/確度。
測量反映了一個“真實”的結(jié)果，即是準(zhǔn)確度。
定量Western Blot除了需要進行
蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上樣電泳、轉(zhuǎn)膜、靶蛋白
抗體孵育、顯色等步驟以外，是一定要檢測內(nèi)參的，也就是內(nèi)部參照（Internal Control），目的是校正蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)印和上樣過程中導(dǎo)致的實驗誤差，保/證實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。對于哺乳動物細(xì)胞表達(dá)來說，內(nèi)參通常指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白(Housekeeping Proteins)，它們在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對恒定，在檢測蛋白的表達(dá)水平變化時常用其作為參照物。
在發(fā)表文章時，Western Blot實驗結(jié)果需內(nèi)參進行校正，但仍有一些科研人員在實驗中忽略內(nèi)參的使用，將蛋白濃度測定作為規(guī)范是比較各種樣品間上樣量等同的唯1方法。然而各種蛋白質(zhì)濃度定量方法，都存在局限性，例如BCA方法對還原性試劑兼容性差，Bradford方法對去垢劑兼容性差，A280方法影響因素比較多，不能完/全準(zhǔn)確的確定各種樣品的蛋白濃度。在Western Blot實驗時使用內(nèi)參，即可簡便地對轉(zhuǎn)印和上樣步驟產(chǎn)生的誤差進行校正。
那么如何實現(xiàn)Western Blot實驗中內(nèi)參的檢測呢？簡單講就是在WB過程中，除加入靶標(biāo)蛋白的抗體外，也加入內(nèi)參蛋白的抗體，同時實現(xiàn)靶標(biāo)蛋白和內(nèi)參蛋白的檢測。通過歸一化，可以校正上樣誤差和轉(zhuǎn)印誤差，從而獲得比較準(zhǔn)確的Western Blot結(jié)果。
使用熒光方法進行定量Western Blot檢測，可進行多重檢測，熒光信號穩(wěn)定，持久，影響因素少，不用剝離膜和剪膜，實驗條件一致，更容易獲得定量Western Blot的數(shù)據(jù)。Azure600可以同時進行4通道熒光成像，無需剝離和重孵育，靶標(biāo)蛋白和內(nèi)參蛋白同時在一張印跡膜上成像，更容易被期刊雜志接收。
如果蛋白表達(dá)是高豐度的，可見熒光方法也可以嘗試，如果是3色RGB可見熒光，能夠同時檢測兩種靶標(biāo)蛋白和一個內(nèi)參蛋白。
原創(chuàng)作者：上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司
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